در ۲۸ دی ۱۳۹۳ برابر با ۲۸ ژانویه ۲۰۱۵، جهاد مغنیه به همراه گروهی از نیروهای حزباللّه هنگام بازدید از شهر «مزرعه الامل» در منطقه «قنیطره»، هدف حمله موشکی بالگرد اسرائیلی قرار گرفت و شهید شد. تحلیلگران معتقدند که تصمیم ترور جهاد مغنیه از سوی شخص بنیامین نتانیاهو نخست وزیر وقت اسراییل صادر شده بود.
به مناسبت سالروز شهادت جهاد مغنیه، فیلمی کمتر دیده شده از ایشان در حال حفاظت از سید حسن نصرالله را مشاهده میکنید.