جدایی‌‌طلب موفق
امیر قلعه‌نویی کار خودش را در لیگ برتر فوتبال ایران از روی نیمکت استقلال و به عنوان دستیار شروع کرد. در لیگ دوم و در زمانی که رولندکخ هدایت استقلال را بر عهده داشت، امیر قلعه‌نویی به عنوان یکی از اعضای کادرفنی این تیم مشغول شد ولی دوام چندانی روی نیمکت این تیم نیاورد و پس از گذشت چند هفته از آغاز لیگ برتر از این تیم جدا شد و به عنوان سرمربی در تیم همنام اهوازی فعالیتش را شروع کرد. قلعه‌نویی 2 بار به عنوان سرمربی استقلال اهواز مقابل استقلال تهران در لیگ دوم قرار گرفت که در بازی رفت تساوی بدون گل و در بازی برگشت پیروزی 2-1 شاگردان قلعه‌نویی نتیجه‌ای بود که در پایان بازی رقم خورد. چند سال بعد عده‌ای از بازیکنان استقلال در مصاحبه‌های خود عنوان کردند به درخواست قلعه‌نویی و برای ماندن استقلال اهواز در لیگ برتر، به این تیم برای پیروزی در دیدار برگشت راه داده‌اند. ادعایی که هرگز اثبات نشد.
بازگشت رویایی با مس
امیر پس از آن 3 فصل موفق را در استقلال سپری کرد که حاصلش یک قهرمانی حذفی و یک قهرمانی لیگ بود و پس از آن به عنوان سرمربی تیم ملی انتخاب شد. امیر در آن مقطع صمد مرفاوی را به جای خود روی نیمکت استقلال نشاند و خودش به عنوان رئیس سازمان فوتبال در این تیم ادامه فعالیت داد تا همزمان در تیم ملی و استقلال قدرت را در دست داشته باشد. همین موضوع باعث شد نه در تیم ملی به نتیجه دلخواه برسد و نه استقلال را عاقبت بخیر کند. برکناری از تیم ملی و مقصر جلوه داده شدن در حذف استقلال در آسیا به خاطر عدم ارسال به موقع مدارک به AFC باعث شد قلعه‌نویی چند ماه خانه نشین شود و در نیم فصل دوم لیگ هفتم کار خود را از تیم بحران زده مس کرمان آغاز کرد که اوضاع خوبی با فرهاد کاظمی نداشت. قلعه‌نویی توانست مس را احیا کند و در تک دیدار خود در آن فصل مقابل استقلال هم موفق شد با نتیجه 1-0 به پیروزی برسد.
دوران طلایی با طلایی‌پوشان
قلعه‌نویی پس از قهرمان کردن استقلال در لیگ هشتم، با مدیریت فصل استقلال، واعظی آشتیانی به مشکل خورد و با جدایی از تیم محبوب خود به اصفهان رفت تا دوران خود را در سپاهان آغاز کند. دو فصل رویایی که با دو قهرمانی پیاپی همراه بود. قلعه‌نویی در 2 سال حضور خود روی نیمکت استقلال 4 بار با استقلال دیدار کرد که در فصل اول دیدار رفت را با نتیجه یک بر صفر واگذار کرد ولی در دیدار برگشت 2-0 به پیروزی رسید.
فصل بعد و در تقابل با استقلال مظلومی در یک دیدار دراماتیک بازی رفت با 4-3 در ورزشگاه آزادی واگذار کرد و بازی برگشت با تساوی 1-1 به پایان رسید.
ماجراجویی در تبریز
پس از 2 قهرمانی در اصفهان، قلعه‌نویی با مدیران سپاهان هم به مشکل خورد تا از این تیم جدا شود و راه تبریز را در پیش گیرد. قلعه‌نویی در تبریز هم حضور موفقی داشت و توانست با کسب عنوان نایب قهرمانی، برای اولین بار برای این تیم سهمیه آسیایی بگیرد. در دو بازی قلعه‌نویی روی نیمکت تراکتورسازی مقابل استقلال در لیگ یازدهم، بازی رفت با نتیجه 2-0 به سود نماینده تبریز به پایان رسید ولی قلعه‌نویی در دیدار برگشت که با قضاوت عجیب و پراشتباه محسن ترکی همراه بود، با دو گل مجتبی جباری از روی نقطه پنالتی بازی را 2-0 واگذار کرد.
حضور کوتاه و ناموفق در ملوان
حضور سه ساله قلعه‌نویی در استقلال در لیگ‌های دوازدهم - سیزدهم و چهاردهم که پایان خوشی نداشت باعث شد قلعه‌نویی از این تیم کنار گذاشته شود و مجددا جای خود را به مظلومی دهد. قلعه‌نویی فصل را با ملوان شروع کرد ولی پس از چند هفته از این تیم جدا شد. تنها حاصل حضور کوتاه مدت او روی نیمکت ملوان، دیدار حساس مقابل استقلال بود که با 2 گل امید ابراهیمی، بازی را با نتیجه 2-0 واگذار کرد.
پاسخ به زبان‌درازی رحمتی
قلعه‌نویی نیم فصل دوم را با بازگشت به تراکتورسازی آغاز کرد. در تنها دیدارش مقابل استقلال در نیم فصل دوم فصل پانزدهم که به دلیل تشدید اختلاف با رحمتی و عوامل استقلال، در یک بازی پرحاشیه که با درگیری لفظی او با رحمتی همراه بود، توانست با نتیجه 3-2 پیروز شود. این دیدار نقش پررنگی در خارج شدن استقلال در کورس قهرمانی در هفته یکی مانده به پایان لیگ برتر داشت که باعث موضع‌گیری شدید هواداران استقلال علیه قلعه‌نویی و محبوبیت او میان پرسپولیسی‌ها شود.
پیروزی استاد مقابل شاگرد
قلعه‌نویی فصل شانزدهم را هم با تراکتورسازی آغاز کرد و در دیدار رفت خود با استقلال توانست با نتیجه 2-1 پیروز شود. این اولین تقابل قلعه‌نویی با استقلال تحت هدایت منصوریان بود که یک روز به عنوان بازیکن در تیم او حضور داشته است.
آمار کلی:
قلعه‌نویی تا کنون در مجموع 12 بار در لیگ برتر مقابل استقلال قرار گرفته است که حاصل آن 6 پیروزی و 4 شکست بوده است و 2 بازی هم به تساوی انجامیده است. تیم‌های قلعه‌نویی مقابل استقلال 17 گل زده‌اند و در مقابل 16 بار دروازه‌شان باز شده است. باید دید دیدار روز پنجشنبه دو تیم چه تغییری در این آمار ایجاد می‌کند.
